Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc1Q61056 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms