Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxg1Q60987 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms