Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp4Q60972 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms