Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf8Q60846 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms