Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf4Q60793 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms