Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbibQ60778 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbibQ60778 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbibQ60778 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms