Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf3Q60765 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf3Q60765 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms