Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgaeQ60677 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgaeQ60677 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms