Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp13a3Q5XF89 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a3Q5XF89 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a3Q5XF89 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms