Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NacadQ5SWP3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NacadQ5SWP3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NacadQ5SWP3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms