Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CluhQ5SW19 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CluhQ5SW19 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CluhQ5SW19 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CluhQ5SW19 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms