Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AbrQ5SSL4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AbrQ5SSL4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms