Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TefmQ5SSK3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms