Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85aQ5SP85 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85aQ5SP85 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms