Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdh12Q5RJH3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh12Q5RJH3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.6 ms