Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trav2Q5R1I9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav2Q5R1I9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms