Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv4Q5R1A3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv4Q5R1A3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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