Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trim41Q5NCC3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms