Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r209Q5NC97 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r209Q5NC97 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r209Q5NC97 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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