Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810065E05RikQ5NC41 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms