Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr39u1Q5M8N4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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