Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf3Q5HZG4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms