Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prkaa1Q5EG47 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms