Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hspb6Q5EBG6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb6Q5EBG6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms