Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam208bQ5DTT3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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