Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf608Q56A10 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Znf608Q56A10 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf608Q56A10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms