Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccnl1Q52KE7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccnl1Q52KE7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms