Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM9

C1ql4, Complement C1q-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql4Q4ZJM9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql4Q4ZJM9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1ql4Q4ZJM9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms