Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otol1Q4ZJM7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otol1Q4ZJM7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms