Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc84Q4VA36 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc84Q4VA36 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms