Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms