Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shank3Q4ACU6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shank3Q4ACU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shank3Q4ACU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms