Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Brinp3Q499E0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brinp3Q499E0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms