Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms