Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldlrad2Q3V0V0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms