Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Garnl3Q3V0G7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Garnl3Q3V0G7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms