Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc27Q3V036 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc27Q3V036 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms