Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn4Q3UV66 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slfn4Q3UV66 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms