Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr1d1Q3UV55 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr1d1Q3UV55 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms