Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd9Q3UQU0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms