Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms