Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam198bQ3UPI1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam198bQ3UPI1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam198bQ3UPI1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms