Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms