Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mccc2Q3ULD5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mccc2Q3ULD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms