Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms