Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnrc6cQ3UHC0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms