Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms