Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms