Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Rnf180Q3U827 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Rnf180Q3U827 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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