Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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Gtpbp6Q3U6U5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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Gtpbp6Q3U6U5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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Gtpbp6Q3U6U5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp6Q3U6U5 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms